Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук
+7 (3952) 42-65-04
info@lin.irk.ru

Таблица школа ДНК Баркодинга

№ занятия Тема занятия Файл с презентацией Преподаватель
1 Использование командной строки в обработке геномных данных. https://vk.com/video185207408_456239953

Тема 1

к.т.н. И.С. Петрушин (ИГУ)
2 Удаленный доступ к высокопроизводительным компьютерам под управлением операционной системы Linux. https://vk.com/video185207408_456239953

Тема 2

к.т.н. И.С. Петрушин (ИГУ)
3 Введение в язык программирования R. https://vkvideo.ru/video5658227_456239342

Тема 3

к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН)
4 ДНК-баркодинг: маркеры, эволюционные дистанции и идентификация видов. https://vkvideo.ru/video5658227_456239341

Тема 4

к.б.н. Т. Е. Перетолчина (ЛИН СО РАН)
5 Базы данных для метабаркодинга, автоматизация сопоставления собственных данных с базами данных, приложение BLAST. https://vkvideo.ru/video5658227_456239340

Тема 5

к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН)
6 Метабаркодинг: основные принципы, цели и задачи, высокопроизводительное секвенирование.https://vkvideo.ru/video5658227_456239343 https://vkvideo.ru/video5658227_456239351

Тема 6a Тема 6b

к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН), к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН)
7 Использование программы USEARCH в анализе данных метабаркодинга https://vkvideo.ru/video5658227_456239348

Тема 7a Тема 7b

к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН), к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН)
8 Использование пакета dada2 в анализе данных метабаркодинга. https://vkvideo.ru/video5658227_456239349

Тема 8a Тема 8b

к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН)
9 Методы вычислительной экологии, многомерной статистики и компьютерной графики, для интерпретации результатов ДНК-метабаркодинга. https://vkvideo.ru/video-220805273_456239055

Тема 9

к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН)
10 Методы математической статистики для анализа влияния внешних факторов на сообщества микроорганизмов. https://vkvideo.ru/video185207408_456239940

Тема 10

к.б.н. Ю.С. Букин (ИГУ, ЛИН СО РАН)
11 ДНК-штрихкодирование растений. https://vkvideo.ru/video185207408_456239927 https://vkvideo.ru/video185207408_456239928

Тема 11

к.б.н. Логачевой Марии Дмитриевны (Сколтех)
12 ДНК-баркодинг для идентификации и уточнения таксономического статуса байкальских беспозвоночных животных. https://vkvideo.ru/video185207408_456239941

Тема 12

к.б.н. Т. Е. Перетолчина (ЛИН СО РАН)
13 ДНК-баркодинг и метабаркодинг в исследованиях почвенных цианобактерий и микроводорослей. https://vkvideo.ru/video185207408_456239936

Тема 13

к.б.н. А.Д. Темралеева (ИБФМ РАН)
14 ДНК-баркодинг и метабаркодинг в исследованиях почвенных цианобактерий и микроводорослей. https://vkvideo.ru/video185207408_456239937

Тема 14

к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН)
15 Использование вторичной структуры межгенных спейсеров для идентификации цианобактерий и микроводорослей. https://vkvideo.ru/video-220805273_456239054

Тема 15

к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН)
16 ДНК-метабаркодинг в исследовании микробных сообществ водной толщи оз. Байкал. https://vkvideo.ru/video-220805273_456239053

Тема 16

к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН)
17 ДНК-метабаркодинг в исследовании сообществ микроэукариот водной толщи оз. Байкал. https://vkvideo.ru/video185207408_456239938

Тема 17

к.б.н. И.С. Михайлов (ЛИН СО РАН)